Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
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