Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
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