Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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C1orf61Q13536 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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C1orf61Q13536 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
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C1orf61Q13536 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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C1orf61Q13536 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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C1orf61Q13536 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms