Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
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