Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms