Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms