Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RASGEF1BQ0VAM2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RASGEF1BQ0VAM2 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RASGEF1BQ0VAM2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RASGEF1BQ0VAM2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RASGEF1BQ0VAM2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RASGEF1BQ0VAM2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RASGEF1BQ0VAM2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RASGEF1BQ0VAM2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RASGEF1BQ0VAM2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RASGEF1BQ0VAM2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RASGEF1BQ0VAM2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RASGEF1BQ0VAM2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RASGEF1BQ0VAM2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RASGEF1BQ0VAM2 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RASGEF1BQ0VAM2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RASGEF1BQ0VAM2 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RASGEF1BQ0VAM2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RASGEF1BQ0VAM2 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RASGEF1BQ0VAM2 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RASGEF1BQ0VAM2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RASGEF1BQ0VAM2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RASGEF1BQ0VAM2 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RASGEF1BQ0VAM2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RASGEF1BQ0VAM2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RASGEF1BQ0VAM2 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RASGEF1BQ0VAM2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RASGEF1BQ0VAM2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RASGEF1BQ0VAM2 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RASGEF1BQ0VAM2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RASGEF1BQ0VAM2 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RASGEF1BQ0VAM2 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms