Protein–RNA interactions for Protein: Q0GE19

SLC10A7, Sodium/bile acid cotransporter 7, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A7Q0GE19 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC10A7Q0GE19 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms