Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms