Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms