Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms