Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms