Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms