Protein–RNA interactions for Protein: P78552

IL13RA1, Interleukin-13 receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL13RA1P78552 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL13RA1P78552 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms