Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms