Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AFDNP55196 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AFDNP55196 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AFDNP55196 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AFDNP55196 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AFDNP55196 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AFDNP55196 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
AFDNP55196 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AFDNP55196 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AFDNP55196 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AFDNP55196 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AFDNP55196 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AFDNP55196 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
AFDNP55196 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
AFDNP55196 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AFDNP55196 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
AFDNP55196 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AFDNP55196 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
AFDNP55196 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AFDNP55196 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
AFDNP55196 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
AFDNP55196 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AFDNP55196 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AFDNP55196 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
AFDNP55196 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
AFDNP55196 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
AFDNP55196 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
AFDNP55196 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
AFDNP55196 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFDNP55196 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFDNP55196 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFDNP55196 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFDNP55196 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFDNP55196 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFDNP55196 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFDNP55196 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFDNP55196 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFDNP55196 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFDNP55196 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFDNP55196 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFDNP55196 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFDNP55196 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFDNP55196 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFDNP55196 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFDNP55196 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFDNP55196 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFDNP55196 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFDNP55196 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFDNP55196 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFDNP55196 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFDNP55196 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFDNP55196 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFDNP55196 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFDNP55196 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
AFDNP55196 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFDNP55196 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFDNP55196 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFDNP55196 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFDNP55196 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFDNP55196 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFDNP55196 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFDNP55196 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFDNP55196 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFDNP55196 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFDNP55196 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
AFDNP55196 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFDNP55196 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFDNP55196 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFDNP55196 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFDNP55196 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFDNP55196 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFDNP55196 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFDNP55196 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFDNP55196 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFDNP55196 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFDNP55196 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFDNP55196 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFDNP55196 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFDNP55196 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFDNP55196 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFDNP55196 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFDNP55196 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFDNP55196 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFDNP55196 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFDNP55196 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFDNP55196 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFDNP55196 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFDNP55196 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFDNP55196 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFDNP55196 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFDNP55196 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFDNP55196 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFDNP55196 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFDNP55196 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFDNP55196 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFDNP55196 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFDNP55196 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFDNP55196 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFDNP55196 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFDNP55196 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms