Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms