Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP153P49790 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP153P49790 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP153P49790 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP153P49790 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP153P49790 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP153P49790 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP153P49790 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP153P49790 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP153P49790 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP153P49790 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP153P49790 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP153P49790 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP153P49790 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP153P49790 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP153P49790 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP153P49790 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP153P49790 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP153P49790 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP153P49790 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP153P49790 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP153P49790 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP153P49790 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP153P49790 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP153P49790 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP153P49790 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP153P49790 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP153P49790 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP153P49790 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP153P49790 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP153P49790 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP153P49790 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP153P49790 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP153P49790 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP153P49790 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUP153P49790 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUP153P49790 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUP153P49790 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUP153P49790 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUP153P49790 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUP153P49790 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NUP153P49790 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUP153P49790 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUP153P49790 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUP153P49790 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUP153P49790 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUP153P49790 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NUP153P49790 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NUP153P49790 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NUP153P49790 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NUP153P49790 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NUP153P49790 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NUP153P49790 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NUP153P49790 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NUP153P49790 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NUP153P49790 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NUP153P49790 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NUP153P49790 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP153P49790 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP153P49790 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP153P49790 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP153P49790 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP153P49790 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP153P49790 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP153P49790 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP153P49790 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP153P49790 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP153P49790 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP153P49790 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP153P49790 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP153P49790 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP153P49790 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP153P49790 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP153P49790 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP153P49790 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP153P49790 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP153P49790 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP153P49790 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP153P49790 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP153P49790 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP153P49790 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP153P49790 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP153P49790 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP153P49790 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP153P49790 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP153P49790 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP153P49790 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP153P49790 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP153P49790 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP153P49790 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP153P49790 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP153P49790 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP153P49790 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP153P49790 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP153P49790 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP153P49790 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP153P49790 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP153P49790 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP153P49790 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP153P49790 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms