Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPAP49450 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPAP49450 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPAP49450 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPAP49450 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPAP49450 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPAP49450 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPAP49450 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPAP49450 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPAP49450 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPAP49450 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPAP49450 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPAP49450 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPAP49450 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPAP49450 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPAP49450 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPAP49450 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPAP49450 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPAP49450 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPAP49450 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPAP49450 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPAP49450 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPAP49450 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPAP49450 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPAP49450 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPAP49450 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPAP49450 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPAP49450 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPAP49450 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPAP49450 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPAP49450 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPAP49450 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPAP49450 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPAP49450 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPAP49450 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPAP49450 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPAP49450 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPAP49450 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPAP49450 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPAP49450 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPAP49450 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPAP49450 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPAP49450 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPAP49450 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPAP49450 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPAP49450 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPAP49450 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPAP49450 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPAP49450 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPAP49450 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPAP49450 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPAP49450 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPAP49450 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPAP49450 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPAP49450 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPAP49450 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPAP49450 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPAP49450 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPAP49450 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPAP49450 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPAP49450 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPAP49450 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPAP49450 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPAP49450 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPAP49450 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPAP49450 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPAP49450 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPAP49450 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPAP49450 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPAP49450 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPAP49450 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPAP49450 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPAP49450 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPAP49450 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPAP49450 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPAP49450 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPAP49450 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPAP49450 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPAP49450 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPAP49450 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPAP49450 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPAP49450 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPAP49450 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPAP49450 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPAP49450 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPAP49450 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPAP49450 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPAP49450 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPAP49450 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPAP49450 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPAP49450 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPAP49450 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPAP49450 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPAP49450 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPAP49450 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPAP49450 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPAP49450 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPAP49450 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPAP49450 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPAP49450 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms