Protein–RNA interactions for Protein: P49023

PXN, Paxillin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXNP49023 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PXNP49023 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PXNP49023 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PXNP49023 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PXNP49023 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PXNP49023 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PXNP49023 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PXNP49023 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PXNP49023 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PXNP49023 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PXNP49023 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PXNP49023 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PXNP49023 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PXNP49023 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PXNP49023 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PXNP49023 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PXNP49023 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PXNP49023 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PXNP49023 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PXNP49023 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PXNP49023 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PXNP49023 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PXNP49023 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PXNP49023 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PXNP49023 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PXNP49023 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PXNP49023 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PXNP49023 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PXNP49023 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PXNP49023 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PXNP49023 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PXNP49023 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PXNP49023 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PXNP49023 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PXNP49023 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PXNP49023 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PXNP49023 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PXNP49023 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PXNP49023 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PXNP49023 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PXNP49023 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PXNP49023 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PXNP49023 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PXNP49023 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PXNP49023 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PXNP49023 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PXNP49023 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PXNP49023 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PXNP49023 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PXNP49023 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PXNP49023 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PXNP49023 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PXNP49023 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PXNP49023 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PXNP49023 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PXNP49023 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PXNP49023 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PXNP49023 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PXNP49023 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PXNP49023 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PXNP49023 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PXNP49023 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PXNP49023 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PXNP49023 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PXNP49023 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PXNP49023 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PXNP49023 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PXNP49023 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PXNP49023 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PXNP49023 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PXNP49023 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PXNP49023 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PXNP49023 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PXNP49023 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PXNP49023 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PXNP49023 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PXNP49023 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PXNP49023 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PXNP49023 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PXNP49023 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PXNP49023 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PXNP49023 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PXNP49023 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PXNP49023 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PXNP49023 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PXNP49023 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PXNP49023 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PXNP49023 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PXNP49023 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PXNP49023 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PXNP49023 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PXNP49023 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PXNP49023 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PXNP49023 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PXNP49023 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PXNP49023 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PXNP49023 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PXNP49023 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PXNP49023 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PXNP49023 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms