Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms