Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms