Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DNMT1P26358 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms