Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD58P19256 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CD58P19256 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD58P19256 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD58P19256 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD58P19256 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CD58P19256 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD58P19256 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD58P19256 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD58P19256 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD58P19256 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD58P19256 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD58P19256 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD58P19256 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD58P19256 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD58P19256 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD58P19256 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD58P19256 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD58P19256 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD58P19256 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD58P19256 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD58P19256 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD58P19256 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD58P19256 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD58P19256 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD58P19256 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD58P19256 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD58P19256 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD58P19256 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD58P19256 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD58P19256 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD58P19256 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD58P19256 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD58P19256 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD58P19256 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD58P19256 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD58P19256 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD58P19256 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD58P19256 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD58P19256 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD58P19256 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD58P19256 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD58P19256 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD58P19256 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD58P19256 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD58P19256 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD58P19256 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD58P19256 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD58P19256 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD58P19256 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD58P19256 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD58P19256 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD58P19256 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD58P19256 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD58P19256 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD58P19256 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD58P19256 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD58P19256 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD58P19256 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD58P19256 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD58P19256 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD58P19256 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD58P19256 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD58P19256 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD58P19256 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD58P19256 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD58P19256 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD58P19256 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD58P19256 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD58P19256 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD58P19256 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD58P19256 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD58P19256 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD58P19256 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD58P19256 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD58P19256 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD58P19256 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD58P19256 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD58P19256 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD58P19256 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD58P19256 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD58P19256 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD58P19256 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD58P19256 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD58P19256 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CD58P19256 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD58P19256 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD58P19256 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD58P19256 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD58P19256 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD58P19256 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD58P19256 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD58P19256 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD58P19256 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD58P19256 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD58P19256 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD58P19256 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD58P19256 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD58P19256 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD58P19256 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms