Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB1P08034 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB1P08034 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB1P08034 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB1P08034 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB1P08034 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB1P08034 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB1P08034 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB1P08034 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB1P08034 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB1P08034 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB1P08034 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB1P08034 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB1P08034 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB1P08034 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB1P08034 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB1P08034 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB1P08034 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB1P08034 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB1P08034 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB1P08034 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB1P08034 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB1P08034 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB1P08034 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB1P08034 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB1P08034 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB1P08034 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB1P08034 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB1P08034 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB1P08034 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB1P08034 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB1P08034 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB1P08034 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB1P08034 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB1P08034 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB1P08034 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB1P08034 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB1P08034 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB1P08034 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB1P08034 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB1P08034 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB1P08034 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB1P08034 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB1P08034 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB1P08034 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB1P08034 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB1P08034 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB1P08034 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB1P08034 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB1P08034 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB1P08034 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB1P08034 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB1P08034 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB1P08034 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB1P08034 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB1P08034 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB1P08034 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB1P08034 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB1P08034 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB1P08034 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB1P08034 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB1P08034 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB1P08034 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB1P08034 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB1P08034 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB1P08034 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB1P08034 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB1P08034 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB1P08034 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB1P08034 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB1P08034 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB1P08034 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB1P08034 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB1P08034 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB1P08034 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB1P08034 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB1P08034 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB1P08034 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB1P08034 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB1P08034 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB1P08034 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB1P08034 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB1P08034 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB1P08034 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB1P08034 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB1P08034 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB1P08034 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB1P08034 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB1P08034 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB1P08034 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB1P08034 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB1P08034 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB1P08034 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB1P08034 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB1P08034 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB1P08034 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB1P08034 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB1P08034 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB1P08034 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB1P08034 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms