Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSF1RP07333 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms