Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG12O94817 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG12O94817 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG12O94817 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG12O94817 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG12O94817 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG12O94817 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG12O94817 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG12O94817 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG12O94817 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG12O94817 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG12O94817 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG12O94817 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG12O94817 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG12O94817 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG12O94817 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG12O94817 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG12O94817 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG12O94817 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG12O94817 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG12O94817 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG12O94817 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG12O94817 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG12O94817 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG12O94817 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG12O94817 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG12O94817 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG12O94817 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG12O94817 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG12O94817 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG12O94817 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG12O94817 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG12O94817 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG12O94817 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG12O94817 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG12O94817 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG12O94817 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG12O94817 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG12O94817 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG12O94817 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG12O94817 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG12O94817 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG12O94817 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG12O94817 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG12O94817 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG12O94817 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG12O94817 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG12O94817 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG12O94817 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG12O94817 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG12O94817 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG12O94817 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG12O94817 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG12O94817 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG12O94817 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG12O94817 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG12O94817 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG12O94817 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG12O94817 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG12O94817 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG12O94817 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG12O94817 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG12O94817 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG12O94817 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG12O94817 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG12O94817 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG12O94817 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG12O94817 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG12O94817 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG12O94817 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG12O94817 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG12O94817 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG12O94817 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG12O94817 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG12O94817 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG12O94817 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG12O94817 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG12O94817 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG12O94817 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG12O94817 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG12O94817 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG12O94817 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG12O94817 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG12O94817 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG12O94817 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG12O94817 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG12O94817 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG12O94817 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG12O94817 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG12O94817 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG12O94817 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG12O94817 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG12O94817 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG12O94817 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG12O94817 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG12O94817 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG12O94817 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG12O94817 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG12O94817 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG12O94817 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms