Protein–RNA interactions for Protein: O60759

CYTIP, Cytohesin-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTIPO60759 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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CYTIPO60759 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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CYTIPO60759 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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CYTIPO60759 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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CYTIPO60759 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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CYTIPO60759 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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CYTIPO60759 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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CYTIPO60759 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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CYTIPO60759 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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CYTIPO60759 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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CYTIPO60759 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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CYTIPO60759 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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CYTIPO60759 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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