Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CREB3O43889 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CREB3O43889 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CREB3O43889 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CREB3O43889 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CREB3O43889 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CREB3O43889 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CREB3O43889 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CREB3O43889 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CREB3O43889 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CREB3O43889 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CREB3O43889 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CREB3O43889 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CREB3O43889 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CREB3O43889 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CREB3O43889 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CREB3O43889 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CREB3O43889 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB3O43889 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB3O43889 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB3O43889 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB3O43889 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB3O43889 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB3O43889 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB3O43889 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB3O43889 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB3O43889 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB3O43889 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB3O43889 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB3O43889 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB3O43889 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB3O43889 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB3O43889 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB3O43889 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB3O43889 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB3O43889 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB3O43889 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB3O43889 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB3O43889 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB3O43889 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB3O43889 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB3O43889 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB3O43889 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB3O43889 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB3O43889 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB3O43889 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB3O43889 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB3O43889 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB3O43889 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB3O43889 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB3O43889 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB3O43889 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB3O43889 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB3O43889 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB3O43889 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB3O43889 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB3O43889 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB3O43889 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB3O43889 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB3O43889 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB3O43889 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB3O43889 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB3O43889 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB3O43889 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB3O43889 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB3O43889 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB3O43889 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB3O43889 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB3O43889 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB3O43889 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB3O43889 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB3O43889 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB3O43889 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB3O43889 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB3O43889 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB3O43889 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB3O43889 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB3O43889 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB3O43889 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB3O43889 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB3O43889 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB3O43889 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB3O43889 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB3O43889 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB3O43889 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB3O43889 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB3O43889 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB3O43889 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB3O43889 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB3O43889 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB3O43889 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB3O43889 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB3O43889 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB3O43889 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB3O43889 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB3O43889 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB3O43889 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB3O43889 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB3O43889 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB3O43889 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms