Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTSS1O43312 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
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