Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms