Protein–RNA interactions for Protein: H3BMQ9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BMQ9 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BMQ9 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BMQ9 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BMQ9 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BMQ9 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BMQ9 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BMQ9 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BMQ9 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BMQ9 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BMQ9 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BMQ9 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BMQ9 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BMQ9 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BMQ9 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BMQ9 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BMQ9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BMQ9 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BMQ9 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BMQ9 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BMQ9 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BMQ9 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BMQ9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BMQ9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BMQ9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BMQ9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BMQ9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BMQ9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BMQ9 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BMQ9 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BMQ9 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BMQ9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BMQ9 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BMQ9 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BMQ9 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BMQ9 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BMQ9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BMQ9 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BMQ9 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BMQ9 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BMQ9 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BMQ9 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BMQ9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BMQ9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BMQ9 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BMQ9 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BMQ9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BMQ9 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BMQ9 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BMQ9 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BMQ9 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BMQ9 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BMQ9 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BMQ9 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BMQ9 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BMQ9 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BMQ9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BMQ9 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BMQ9 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BMQ9 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BMQ9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BMQ9 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BMQ9 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BMQ9 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BMQ9 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BMQ9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BMQ9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BMQ9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BMQ9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BMQ9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BMQ9 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BMQ9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BMQ9 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BMQ9 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BMQ9 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BMQ9 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BMQ9 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BMQ9 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BMQ9 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BMQ9 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BMQ9 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BMQ9 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BMQ9 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BMQ9 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BMQ9 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BMQ9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BMQ9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BMQ9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BMQ9 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BMQ9 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BMQ9 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BMQ9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BMQ9 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BMQ9 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BMQ9 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BMQ9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BMQ9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BMQ9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BMQ9 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BMQ9 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BMQ9 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms