Protein–RNA interactions for Protein: E9PRG8

C11orf98, Uncharacterized protein C11orf98, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf98E9PRG8 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms