Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms