Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRAMEF25A6NGN4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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