Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms