Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ87

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQ87 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQ87 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQ87 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQ87 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQ87 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQ87 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQ87 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQ87 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQ87 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQ87 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQ87 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQ87 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQ87 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQ87 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQ87 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQ87 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQ87 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQ87 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQ87 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQ87 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQ87 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQ87 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQ87 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQ87 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQ87 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQ87 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQ87 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQ87 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQ87 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQ87 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQ87 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQ87 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQ87 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
U3KQ87 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQ87 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQ87 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQ87 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQ87 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQ87 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQ87 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQ87 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQ87 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQ87 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQ87 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQ87 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQ87 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQ87 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQ87 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQ87 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQ87 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQ87 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQ87 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQ87 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQ87 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQ87 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQ87 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQ87 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQ87 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQ87 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQ87 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQ87 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQ87 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQ87 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQ87 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQ87 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQ87 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQ87 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQ87 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQ87 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQ87 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQ87 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQ87 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQ87 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQ87 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQ87 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQ87 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQ87 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQ87 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQ87 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQ87 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQ87 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQ87 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQ87 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQ87 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQ87 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQ87 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
U3KQ87 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQ87 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQ87 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQ87 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQ87 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQ87 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQ87 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQ87 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQ87 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQ87 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQ87 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQ87 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQ87 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQ87 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms