Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms