Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms