Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms