Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms