Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NRXN1Q9ULB1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NRXN1Q9ULB1 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NRXN1Q9ULB1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NRXN1Q9ULB1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NRXN1Q9ULB1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NRXN1Q9ULB1 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NRXN1Q9ULB1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NRXN1Q9ULB1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NRXN1Q9ULB1 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NRXN1Q9ULB1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
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