Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MLH3Q9UHC1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms