Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms