Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms