Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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