Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms