Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOMER3Q9NSC5 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HOMER3Q9NSC5 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOMER3Q9NSC5 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOMER3Q9NSC5 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOMER3Q9NSC5 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOMER3Q9NSC5 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOMER3Q9NSC5 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms