Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.3■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.29■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.29■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.29■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.28■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.28■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.28■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.28■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.27■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
INCENPQ9NQS7 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms