Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms